Podczas transportowania helikopterem Głównego Bakurdzenia Ekstra Ekipa musi stanąć do walki. Prace badawcze przynoszą lepsze efekty, niż wojownicy się tego spodziewali.
Tajemnicza więź między Ekstra Ekipą a Głównym Bakurdzeniem ma straszne konsekwencje. Na jaw wychodzą prawdziwe zamiary Philomeny, która pragnie utworzyć świat idealny.
Chcąc udaremnić zamiary Philomeny, Ekstra Ekipa zawiera wątpliwy sojusz z Bentonem. Podczas ostatecznej walki bakuganów lojalność partnerów zostaje wystawiona na próbę.
Nowa przygoda Ekstra Ekipy rozpoczyna się na tropikalnej wyspie, która nie jest taka spokojna — ani bezludna — jak się wydaje. Poruszające odkrycie zmienia ich misję.
Ekscytujące zaproszenie i sygnał Głównego Rdzenia sprowadzają Ekstra Ekipę na wyspę Brakistan. Tam poznają jej dziwnego młodego króla, który pragnie zostać wojownikiem.
Nowy filmik Dana i Wyntona zagraża ich sekretnej misji. Ekstra Ekipa i Magnus wpadają na siebie w czasie poszukiwań Głównego Rdzenia i spotykają jego obrońcę.
Ekstra Ekipa podąża za dziwnym sygnałem i odkrywa wielką operację na sztucznej wyspie. Shun spotyka się z dawno niewidzianym ojcem i staje przed trudnym wyborem.
Co cię nie zabije, to cię wzmocni /Imperium Kazami
Drago ma niepokojącą wizję, ale tata Shuna ignoruje ostrzeżenia. Masato uwalnia potężne zagrożenie, przez które bohaterowie muszą przekroczyć granicę własnej odwagi.
Gdy Ekstra Ekipa zaczyna wątpić w plan Bentona z ogólnodostępną siecią, ten zaprasza ich na luksusową imprezę na basenie. Powraca stary wróg, silniejszy niż kiedykolwiek.