A Cabo le toca la vigilancia nocturna y se lleva una caja de dulces desobedeciendo las órdenes de Skipper. En la guardia, Cabo ve una orca inflable flotando en el cielo y Cabo cree que es de verdad y le avisa a todos pero nadie le cree hasta que lo ven y los pingüinos intentan detenerla.
Por un accidente el Rey Julien es lanzado del zoológico después de rebotar en su cama de aire y aterriza en un autobús, después de bajar una mujer llamada Gladys quien piensa que es un gato, se lo lleva a su casa.Mientras Los Pingüinos y Mort y Maurice planean su rescate, Julien se encuentra con Zoe, un hurón que vive en la casa de Gladys para recibir comida gratis y no volver a las calles.Aunque no tiene interés en él, Julien intentara de ganarse su afecto.
Clemnson regresa de hoboken con pruebas de que julien no nació en madagascar por lo tanto no puede ser rey mort y maurice van con los pingüinos para explicar el asunto murice les dice que si julien gana una carrera de obstáculos voleria a ser rey. kowaslki sugiere cambiar cerebros con julien pero debido al nuevo telescopio de los pingüinos clemnson ve quien esta en el cuerpo de julien entonces cambia los eventos para el facaso de cabo, kowaslki y Skiper después en la coronación engañan a clemnson usando lo maquina cambia cerebros para cambiar los cuerpos de julien y clemnson después julien (en el cuperpo de clemnson) le da la corona falsa a clemnson (En el cuerpo de julien) después antes de cambiar cerebros julien les dice a los gorilas que aplasto sus banas al final los gorilas persiguen a clemnson
Cuando Marlene se mancha su pelaje después de un accidente con cloro, los pingüinos creen que Marlene es una rara especie en peligro de extinción cuyo nombre es Arlene y Skipper e Julien se pelean por ella.
Despues de derrotar a Hans en un laboratorio de armas a Skipper le cae un líquido que hace que su cuerpo se expanda como un globo cuando se altera mucho, entonces Skipper no podrá luchar más.
Cuando intentan conseguir alimento para los Camaleones, Los Pingüinos le piden prestado a Julien el pulgar de Maurice, el acepta pero cuando este pasa mucho tiempo con los Pingüinos se pone celoso.
Kowalski inventa el Pesca Churro : una máquina que combinan los pescados y los churros asta que descubren que los desechos terminan siendo burbujas azules que cambian el clima y podrían destruir el mundo, entonces estos tienen que dejar de utilizar la máquina y destruir la Gran Burbuja Azul Pero Skipper es adicto a los Pesca Churros.
Una avestruz llamada Shelly se enamora de Rico después de que la salvara pero cuando ella se entera de que ya tiene una chica (Señorita Perky) ella se quiere deshacer de ella.
Marlene quiere ir a ver a su guitarrista Español Favorito pero no puede ir ya que si sale del zoológico se hace salvaje pero Kowalski inventa una máquina que la divide en sus dos lados por lo que hace miedosa a Marlene.
Despues de uno de los ataques de hanz, los pingüinos salvan a una zarigueya que los empieza a mimar como sus hijos y a ablandarlos, además de que cada vez que tratan de desobedecerla o echarla agoniza, aunque solo finge.
Skipper decide premiar a Cabo por su valiente esfuerzo en las misiones y lo llevan a ver "Lunacornios sobre Hielo" junto con otros dos fans de los lunacornios, ¡Bing y Roy!
Un perro callejero llamado Elmer confunde a Mort con un juguete y se lo lleva. Skipper, Kowalski y Rico piden ayuda a Max para recuperar a Mort, mientras Cabo se queda con Maurice y Julien y se asegura de que ambos se lleven bien.
Skipper ofrece una recompensa a aquel de su equipo que pueda conseguirle un arenque ahumado de la pescadería, lugar donde resulta que el Oficial X tiene su nuevo empleo.
Los pingüinos llevan sus misiones en su hábitat en el Parque Central. Aparecen Julien, el rey de los lémures, y sus súbditos Maurice y Mort, sus nuevos vecinos, que constituyen la exhibición de lémures en el zoológico. Ahora los pingüinos deben mantener las cosas bajo control, a menudo a pesar de las payasadas de los lémures así como auxiliar en labores poco comunes o aventuras fuera de lo común. Skipper rara vez llama al Rey Julien por su nombre, dirigiéndose a él siempre como "Cola anillada" (por ser un lemur de cola anillada).
Creadores
Brandon Sawyer,
Nicholas Filippi
Reparto
John DiMaggio,
Nicole Sullivan,
Jeff Bennett,
Andy Richter,
Kari Wahlgren,
Danny Jacobs,
Mary Scheer,
Tom McGrath,
Conrad Vernon,
Kevin Michael Richardson,
James Patrick Stuart